Ο Βλάσης Μισσός εργάζεται ως ερευνητής στο Κέντρο Προγραμματισμού και Οικονομικών Ερευνών (ΚΕΠΕ) και ως μετα-διδακτορικός ερευνητής στο τμήμα Οικονομικών Επιστημών του ΕΚΠΑ. Τα ενδιαφέροντά του επικεντρώνονται σε θέματα Κοινωνικής Πολιτικής, Φτώχειας και Ανισοτήτων καθώς επίσης και στην Ιστορία της Οικονομικής Σκέψης.
Από το 2015 έως και το 2016, εργάστηκε ως ειδικός σύμβουλος στη Γενική Γραμματεία Δημοσιονομικής Πολιτικής του Υπουργείου Οικονομικών, ενώ την περίοδο 2019 έως 2021, ως σύμβουλος αναπτυξιακής πολιτικής για την κυβέρνηση της Σαμόα, εκπροσωπώντας το Adam Smith International (Σίδνεϋ).
Έχει συμμετάσχει σε διάφορες ανεξάρτητες ερευνητικές ομάδες και projects και έχει εργαστεί στο Ινστιτούτο Εργασίας της ΓΣΕΕ. Η ερευνητική του δουλειά έχει δημοσιευθεί σε ξένα και εγχώρια περιοδικά και είναι συν-συγγραφέας του βιβλίου Πραγματική Οικονομία: Εμπειρίες ανάπτυξης, κρίσης και φτωχοποίησης στην Ελλάδα (2018, Αθήνα: Κριτική) με τον Κωστή Βαΐτσο.